При периодонтите боль чаще локализована при накусывании и постукивании, зуб может казаться «выросшим», иногда есть свищ и ночные боли меньше выражены, чем при пульпите; окончательный диагноз ставится после осмотра, тестов на перкуссию и холод, а также рентгенографии или КЛКТ. Дифференцировать самостоятельными способами эти состояния нельзя, так как клиника пересекается и влияет предшествующий кариес и прежние вмешательства.
Диагностика в клинике включает сбор анамнеза, оценку подвижности и состояния дёсен, термо- и электротесты, прицельный снимок для оценки периодонтальной щели и очага у верхушки, при показаниях — КЛКТ для сложной анатомии или подозрения на трещину. На основании данных определяют форму (острый, хронический, обострение хронического) и планируют объём санации каналов и необходимость временных медикаментов.